Genômica em escala: a transformação digital no Hospital das Clínicas

O setor de saúde enfrenta um desafio crescente: lidar com a explosão de dados genômicos e clínicos e transformá-los em conhecimento aplicável. Nesse cenário, o Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP) reconheceu a necessidade de modernizar seu ambiente de dados para manter a excelência em pesquisa e no cuidado ao paciente.

Quem é o cliente

Inaugurado em 1944, o HCFMUSP é um complexo hospitalar de referência, vinculado à Secretaria de Estado da Saúde para coordenação administrativa e à Faculdade de Medicina da USP para ensino, pesquisa e prestação de serviços de saúde à comunidade.

No contexto das pesquisas genômicas, a UNIFESP conduziu projetos com apoio do HCFMUSP, que disponibilizou sua infraestrutura hospitalar para viabilizar estudos em larga escala, aproximando descobertas científicas da prática clínica e de tratamentos mais personalizados.

Desafio de saúde digital

Hospitais e centros de pesquisa precisam armazenar e processar volumes massivos de dados sensíveis, mantendo governança e conformidade regulatória. Entre os principais gargalos estão: armazenamento seguro de grandes volumes, custo e lentidão de ambientes on-premises, complexidade de governança (incluindo LGPD) e dificuldade de escalabilidade para acompanhar a evolução das pesquisas.

Solução estratégica

A proposta foi migrar o ambiente de dados do HCFMUSP para sua própria conta AWS, com foco não apenas na migração e sincronização, mas também na avaliação da melhor estratégia de processamento genômico (comparando on-premises com alternativas em nuvem, como Amazon EC2 e AWS HealthOmics).

O projeto incluiu a transferência segura de 367 TB de dados via AWS DataSync (com origem em armazenamento previamente mantido em Glacier), preparação da infraestrutura na AWS, implementação de governança e segurança, e treinamento da equipe do hospital para operar o novo ambiente.

Arquitetura em ação

A arquitetura foi desenhada para suportar ingestão contínua e pesquisa em escala, combinando:

• Amazon S3 como repositório central organizado por tipo de dado;
• AWS DataSync para migração inicial e ingestão contínua;
• Amazon EC2 para executar pipelines genômicos diretamente na nuvem;
• Monitoramento e alertas de custos para controle e visibilidade financeira.

Resultados e benefícios

A iniciativa consolidou uma base moderna para pesquisa genômica, com impactos diretos em eficiência e governança:

• Migração precisa e sem perdas de 367 TB, com estabilidade e desempenho do novo ambiente em nuvem;
• Dados organizados e prontos para pesquisa em escala, com ingestão contínua;
• Redução de custos operacionais ao otimizar processamento e armazenamento;
• Escalabilidade e agilidade para expandir pipelines e acelerar análises, com EC2 e HealthOmics avaliados como alternativas de alta performance;
• Governança estruturada e conformidade assegurada, com auditoria contínua em um ambiente mais integrado.

Próximos passos

Os próximos passos incluem a elaboração de um relatório detalhado de benchmarking para comparar desempenho e custo entre processamento on-premises, EC2 e AWS HealthOmics, apoiando a recomendação da melhor estratégia e preparando o hospital para expandir o uso da nuvem e fortalecer a interoperabilidade de dados para futuras aplicações em medicina personalizada.

Ao unir a capacidade clínica e de pesquisa do HCFMUSP, a colaboração acadêmica com a UNIFESP e a expertise da dataRain em arquitetura e modernização na AWS, o projeto criou as condições para transformar dados genômicos sensíveis em insights aplicáveis — aproximando ciência e cuidado ao paciente em larga escala.